Actionability біомаркерів переходить з OncoKB на CIViC

OpenOnco — безкоштовний публічний ресурс, і CHARTER §2 зобовʼязує його залишатися некомерційним. Багато ліцензій джерел, від яких ми залежимо, діють саме за цієї умови. Аудит ліцензії та покриття OncoKB показав, що його умови використання конфліктують із цим зобовʼязанням, тому шар actionability біомаркерів переведено на CIViC, який публікується під CC0.

Повний аудит, разом із порівнянням покриття, яке зробило цей перехід обґрунтованим клінічно, а не лише юридично, опубліковано у файлі docs/reviews/oncokb-public-civic-coverage-2026-04-27.md.

Що вже зроблено

• Фаза 0 — аудит покриття й ліцензій: порівняння того, що публічні дані OncoKB і CIViC покривають для біомаркерів, уже наявних у базі знань.
• Фаза 1 (коміт 5384348) — модулі engine перейменовано з oncokb_* на actionability_*, проксі-сервіс OncoKB прибрано, а схему узагальнено через блок evidence_sources, щоб жоден окремий постачальник не був вшитий у модель даних.
• Фаза 1.5 (коміт c72e45b) — міграція YAML: 29 файлів біомаркерів переведено з oncokb_lookup на actionability_lookup, а в 399 файлах biomarker_actionability вендорські поля рівня замінено блоком evidence_sources.

Що ще попереду

Фази 2–5 ще не завершені: рідер CIViC і матчер із підтримкою фьюжнів, реконструкція доказової бази для мігрованих записів actionability, оновлення render і специфікацій та фінальна верифікація.