CDKN2A loss (homozygous deletion or biallelic inactivation)
Детермінований перегляд YAML-сутності з джерельної бази. Клінічний авторитет лишається за вказаними source ID та статусом клінічного sign-off.
| ID | BIO-CDKN2A |
|---|---|
| Тип | Біомаркер |
| Синоніми | 9p21 deletionCDKN2A lossp14ARF lossp16 lossВтрата CDKN2A (гомозиготна делеція або біалельна інактивація) |
| Статус | переглянуто 2026-04-27 | очікує клінічного підпису |
| Хвороби | DIS-CHONDROSARCOMA DIS-MPNST |
| Джерела | SRC-ESMO-NSCLC-METASTATIC-2024 SRC-NCCN-MELANOMA-2025 SRC-ONCOKB |
Дані про біомаркер
| Тип біомаркера | copy_number |
|---|---|
| Деталі мутації | {"functional_impact": "Loss of p16(INK4a) tumor-suppressor (CDK4/6 inhibition lost — Rb constitutively phosphorylated) and loss of p14(ARF) (MDM2 destabilization of p53 lost)", "gene": "CDKN2A", "gene_hugo_id": "HGNC:1787", "hotspots": ["Homozygous deletion (9p21.3 — most common mechanism)", "Biallelic inactivation: deletion + mutation", "Promoter hypermethylation (silencing without copy loss)"], "variant_type": "deletion / loss-of-function"} |
| Вимірювання | MethodDNA-NGS with copy-number module (preferred) OR FISH (9p21) OR p16 IHC (loss correlates with biallelic inactivation) UnitsCopy number (0 = homozygous deletion, 1 = heterozygous loss, 2 = neutral) Sensitivity requirementTumor cellularity ≥30% recommended for copy-number calling on DNA-NGS |
| Пов’язані біомаркери | BIO-TP53-MUTATION |
Нотатки
Втрата CDKN2A виявляється у ~50% меланом, ~50% плоскоклітинного НМРЛ, ~80% МПЗН, ~50% гліобластом, ~30% панкреатичного раку. Є маркером несприятливого прогнозу при багатьох нозологіях. Прямо схваленої таргетної терапії не існує. CDK4/6-інгібітори (палбоцикліб (palbociclib), рибоцикліб (ribociclib), абемацикліб (abemaciclib)) є біологічно обґрунтованими (гіпотеза синтетичної летальності: втрата p16 → залежність від CDK4/6), однак великих позитивних клінічних досліджень при солідних пухлинах поза HR+ РМЗ немає. Селективні інгібітори CDK7 / PRMT5 розробляються для пухлин з коделецією MTAP (9p21). При МПЗН втрата CDKN2A є практично універсальною ознакою злоякісної трансформації нейрофіброми.
Де використовується
Diseases
DIS-CHONDROSARCOMA- ChondrosarcomaDIS-GLIOMA-LOW-GRADE- Low-grade glioma (LGG, WHO grade 2 — IDH-mutant)DIS-MASTOCYTOSIS- Advanced systemic mastocytosis (AdvSM)DIS-MPNST- Malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST)
Біомаркер
BIO-1P19Q-CODELETION- 1p/19q codeletionBIO-ATRX-MUTATION- ATRX mutation / ATRX loss (IHC)BIO-FBXW7- FBXW7 loss-of-function mutationBIO-RB1- RB1 loss-of-function (retinoblastoma protein)BIO-TERT- TERT promoter mutation (C228T / C250T)
Тривожна ознака
RF-CHONDROSARCOMA-HIGH-RISK-BIOLOGY- Adverse subtype or molecular feature in chondrosarcoma: dedifferentiated subtype (high-gr...RF-MPNST-HIGH-RISK-BIOLOGY- MPNST with adverse molecular / clinical features: biallelic CDKN2A/B loss (>80% high-grad...