Sophont predice l'attività genica dai vetrini. Che cosa è dimostrato?

Il 20 ottobre la startup Sophont ha annunciato Holon-S1. Il modello prevede dove geni e programmi biologici potrebbero essere attivi in un tumore a partire da un comune vetrino istologico colorato con ematossilina ed eosina. Sophont offre un esempio interattivo e invita a collaborazioni di ricerca. Il rapporto tecnico redatto dall'azienda, datato 13 ottobre, descrive valutazioni retrospettive e casi di ricerca di biomarcatori. Una previsione ricavata da un'immagine non è una misura diretta dell'espressione genica. Questi materiali non dimostrano che l'uso del modello migliori le scelte terapeutiche o la sopravvivenza.

Gli strumenti operano in fasi diverse. Holon-S1 studia immagini tissutali per formulare ipotesi di ricerca; OpenOnco, gratuito e con codice sotto licenza MIT, mostra nel browser regole oncologiche con fonti e bozze alternative per il gruppo multidisciplinare, ma non legge vetrini né misura l'espressione genica. Il codice e le regole di OpenOnco sono pubblici, mentre i contenuti clinici sono ancora in revisione. Al 21 ottobre la pagina di Sophont non pubblicava una licenza del codice di Holon-S1 né un prezzo; proponeva di contattare l'azienda per l'accesso. Nessuno dei due strumenti sostituisce l'anatomia patologica, i test molecolari o il giudizio clinico; manca un confronto diretto degli esiti clinici. Questo articolo non sostituisce un medico qualificato.